黄强

发布者:王诗铭发布时间:2021-06-27浏览次数:4292

教师基本信息

姓名:黄强

职称:教授

职务:教师

电子邮箱:huangqiang@fudan.edu.cn

办公地点:G607

办公电话:021-31246589


研究方向

生物大分子设计、基因编辑系统的结构机理与优化、智能计算生物技术。

个人简介

1991年本科毕业于浙江大学化学系,获学士学位 (化学专业)1994年和1998年分别在浙江大学获得硕士和博士学位 (物理化学专业)1999-2000年间在德国柏林洪堡大学生物系分子生物物理专业从事博士后研究,2001-2003年间继续在该系及到台湾中山大学化学系从事研究。200412月进入永利集团304am官方入口工作,主要从事生物分子结构与相互作用的理论建模、计算模拟和分子设计等研究,2005年起历任副教授、教授 (博士生导师)

近年来专注于结构模拟、智能计算和实验验证相融合的生物大分子前沿研究:生物大分子药物设计、基因编辑酶的结构机理和分子工程优化、生物分子智能计算方法等。已在J. Am. Chem. Soc., Nature Commun., Biosens. Bioelectron., Bioinformatics, Comput. Struct. Biotechnol. J. Protein Cell等知名期刊上发表了SCI论文80多篇,获得了授权发明专利10多项,曾获得第五届中国技术市场协会金桥奖 (第二完成人),上海市科技发明奖二等奖 (第三完成人) 和教育部技术发明奖二等奖 (第三完成人)

授课情况

生物技术专业课《物理化学》、专业选修课《计算结构生物学》

招生专业

遗传学、生物信息学


代表性论文和论著

1. M. Song, Y. Li, R. Gao, J. Liu, Q. Huang*. De novo design of DNA aptamers that target okadaic acid (OA) by docking-then-assembling of single nucleotides. Biosensors & Bioelectronics, 215:114562 (2022).

2. H. Zhu#; W. Du#, M. Song; Q. Liu, A. Herrmann, Q. Huang*. Spontaneous binding of potential COVID-19 drugs (Camostat and Nafamostat) to human serine protease TMPRSS2. Computational & Structural Biotechnology Journal, 19:467-476 (2021).

3. R. Yao, J. Qian, Q. Huang*. Deep-learning with synthetic data enables automated picking of cryo-EM particle images of biological macromolecules. Bioinformatics, 36:1252-1259 (2020).

4. Q. Liu, A. Herrmann, Q. Huang*. Surface binding energy landscapes affect phosphodiesterase isoform-specific inhibitor selectivity. Computational & Structural Biotechnology Journal17:101-109 (2019).

5. C. Huai#, G. Li#, R. Yao, Y. Zhang, M. Cao, L. Kong, C. Jia, H. Yuan, H. Chen, D. Lu*, Q. Huang*. Structural insights into DNA cleavage activation of CRISPR-Cas9 system. Nature Communications, 8:1375 (2017).

6. J. Zhu, Q. Yang, D. Dai, Q. Huang*. X-ray crystal structure of phosphodiesterase 2 in complex with a highly selective, nanomolar inhibitor reveals a binding-induced pocket important for selectivity. Journal of the American Chemical Society, 135: 11708-11711 (2013).

7. Q. Huang*, A. Herrmann. Calculating pH-dependent free energy of proteins by using Monte Carlo protonation probabilities of ionizable residues. Protein & Cell, 3:230-238 (2012).

8. H. Shen, F. Xu, H. Hu, F. Wang, Q. Wu, Q. Huang*, H. Wang*. Coevolving residues of (/)8-barrel proteins play roles in stabilizing active site architecture and coordinating protein dynamics. Journal of Structural Biology. 164:281-292 (2008).

9. Q. Huang, C.- L. Chen, A. Herrmann. Bilayer conformation of fusion peptide of influenza virus hemagglutinin: a molecular dynamics simulation study. Biophysical Journal, 87:14-22 (2004).

10. Q. Huang, R. Opitz, E.-W. Knapp, A. Herrmann. Protonation and stability of the globular domain of influenza virus hemagglutinin. Biophysical Journal, 82:1050-1058 (2002).